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Venerdì, 23 Febbraio 2018

Dolphin Morbillivirus: caratterizzazione del genoma completo

  • Applicata per la prima volta la tecnologia NGS su un ceppo virale rappresentativo della grande epidemia del 2006-2008 nel Mar Mediterraneo
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Schermata 2018 02 21 alle 11.04.31Il Dolphin Morbillivirus (DMV) dell’epidemia avvenuta fra il 1990 e il 1992 nel Mar Mediterraneo è l’unico morbillivirus dei cetacei il cui genoma sia stato completamente sequenziato. In questo lavoro è stata applicata per la prima volta la tecnologia Next Generation Sequencing (NGS) per lo studio dei morbillivirus dei mammiferi marini. Un ceppo virale, rappresentativo della seconda grande epidemia (2006-2008) nel Mar Mediterraneo (DMV_IZSPLV_2008), è stato isolato in vitro utilizzando cellule della linea Vero.DogSLAMtag; l’intero genoma è stato successivamente sequenziato mediante NGS.

La lunghezza del genoma risultante è stata determinata in 15.673 paia di basi. Il confronto fra i genomi dei ceppi rappresentativi delle due epidemie (2006-‘08 e 1990-‘92) ha evidenziato 157 mutazioni nucleotidiche, 47 sostituzioni amminoacidiche nelle sequenze polipeptidiche correlate, e una similarità del 98,7% sull’intera sequenza.

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Scritto da
Maria Grazia Monzeglio Med Vet PhD

Letto 823 volte Ultima modifica il Giovedì, 22 Febbraio 2018 10:36

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