L'occhio ospita una miriade di organismi batterici, fungini e virali che probabilmente influenzano la fisiologia della superficie oculare in stati patologici e parafisiologici. Il mycobiota della superficie oculare dei cavalli non è stato ancora descritto utilizzando le tecniche NGS. Questo studio mirava a caratterizzare il microbiota fungino della superficie oculare (mycobiota) in cavalli sani in 2 condizioni ambientali (in stallo e al pascolo).

 I tamponi congiuntivali di entrambi gli occhi sono stati ottenuti da 7 stalloni adulti allevati in un padiglione all'aperto e 5 fattrici adulte che vivono al pascolo. Il DNA genomico è stato estratto dai tamponi della superficie oculare e sequenziato utilizzando primer che mirano alla regione dello spaziatore interno trascritto 1 (ITS1) del genoma fungino su una piattaforma Illumina. Le sequenze sono state elaborate utilizzando Quantitative Insights Into Molecular Ecology (QIIME 2.0) e la tassonomia assegnata con Findley et al. Database ITS1 2013. 

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